真菌寄生于植物并引致的病害叫真菌病害。真菌在营养生长阶段的结构叫营养体，主要功能是吸收。输送和贮存营养，为繁殖生长做准备。真菌的营养体还可以形成菌组织以及菌体的变态结构。已记载的植物病原真菌有8000种以上。一种作物上可能发生几种甚至几十种真菌病害。植物上常见的霜茁病、白粉病、锈病和黑粉病四大病害都是由真菌引起的。历史上曾流行的桢物病害多数是真菌病害。
常见的作物真菌病害症状有霜霉、白粉、白锈、黑粉、锈粉、烟煤、黑痣、霉状物、蘑菇状物、棉絮状物、颗粒状物、绳索状物、黏质粒和小黑点等，许多大的症状可用肉眼直接观察到。引起作物真菌病害的病原真菌有绵祗菌、腐霉菌、疫霉菌、白锈菌、白粉菌、黑星菌、黑粉菌、囊壳菌和半知菌类等。
真菌病害的侵染循环类型多，许多病菌可形成特殊的组织或孢子越冬。在热带和亚热带，不少病菌不越冬而越夏。大多数病菌的有性孢子在侵染循环中起重要作用，其无性孢子则起不断再侵染的作用。真菌病害主要靠气流、水流传播，其次为风、雨、昆虫传播等。
真菌性病害的特征
1.一定有病斑存在于植株的各个部位。病斑形状有圆形、椭圆形、多角形、轮纹形或不定形。
2.病斑上一定有不同颜色的霉状物或粉状物，颜色有白、黑、红、灰、褐等。例如黄瓜白粉病，叶上病斑处出现白色粉状物。再如瓜类与番茄灰霉病，受害叶片、残花及果实上出现灰色霉状物。细菌性病害在蔬菜上出现的细菌性病害约有300种，常见的有100余种，占整个蔬菜病害的10%左右。
真菌性病害可以危害粮食作物、经济作物、水果、蔬菜等等，例如，低等真菌引起的病害，常见的有：霜霉病、猝倒病、晚疫病等。高等真菌引起的病害，常见的有：白粉病、炭疽病、锈病等。
作物常见病害：
炭疽病：主要危害果实，叶片、果梗也可受害。果实染病，初现水浸状黄褐色圆斑，边缘褐色，中央呈灰褐色，表面有隆起的同心轮纹，往往由许多小点集成，小点有时为黑色，有时呈橙红色。潮湿时，病斑表面溢出红色黏稠物。被害果内部组织半软腐，易干缩，致病部呈膜状，有的破裂。叶片染病，初为褪绿色水浸状斑点，后渐变为褐色，中间淡灰色，近圆形，其上轮生小点。果梗被害后生褐色凹陷斑，病斑不规则，干枯时往往开裂。
锈病：危害植物的叶、茎和果实。锈菌一般只引起局部侵染，受害部位可因孢子积集而产生不同颜色的小疱点或疱状、杯状、毛状物，有的还可在枝干上引起肿瘤、粗皮、丛枝、曲枝等症状，或造成落叶、焦梢、生长不良等。严重时孢子堆密集成片，植株因体内水分大量蒸发而迅速枯死。
白粉病：主要危害叶片，也危害茎和穗子。发病初期为白色病斑，而后颜色逐渐变为浅棕色，可通过自交或杂交形成黑色的子囊壳 。一般情况下部叶片比上部叶片多，叶片背面比正面多。霉斑早期单独分散，后联合成一个大霉斑，甚至可以覆盖全叶，严重影响光合作用，使正常新陈代谢受到干扰，造成早衰，产量受到损失。
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防治对象：主要用于防治蔬菜、果树上的锈病、白粉病、炭疽病、霜霉病、褐斑病、早晚疫病等多种真菌性病害。